Protein–RNA interactions for Protein: O54909

Rdh16, Cis-retinol androgen dehydrogenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rdh16O54909 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rdh16O54909 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rdh16O54909 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rdh16O54909 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Rdh16O54909 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rdh16O54909 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Rdh16O54909 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Rdh16O54909 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rdh16O54909 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Rdh16O54909 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Rdh16O54909 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rdh16O54909 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rdh16O54909 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rdh16O54909 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rdh16O54909 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rdh16O54909 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rdh16O54909 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rdh16O54909 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rdh16O54909 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rdh16O54909 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rdh16O54909 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rdh16O54909 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rdh16O54909 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rdh16O54909 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rdh16O54909 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rdh16O54909 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Rdh16O54909 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rdh16O54909 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rdh16O54909 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
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