Protein–RNA interactions for Protein: O54693

Eda, Ectodysplasin-A, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EdaO54693 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EdaO54693 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EdaO54693 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EdaO54693 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EdaO54693 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EdaO54693 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
EdaO54693 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EdaO54693 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EdaO54693 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EdaO54693 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EdaO54693 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EdaO54693 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EdaO54693 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EdaO54693 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EdaO54693 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EdaO54693 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EdaO54693 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EdaO54693 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EdaO54693 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EdaO54693 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EdaO54693 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EdaO54693 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EdaO54693 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EdaO54693 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EdaO54693 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EdaO54693 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EdaO54693 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EdaO54693 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EdaO54693 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EdaO54693 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EdaO54693 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EdaO54693 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EdaO54693 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EdaO54693 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EdaO54693 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EdaO54693 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EdaO54693 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EdaO54693 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EdaO54693 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EdaO54693 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EdaO54693 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EdaO54693 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EdaO54693 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EdaO54693 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EdaO54693 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EdaO54693 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EdaO54693 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EdaO54693 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EdaO54693 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EdaO54693 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EdaO54693 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EdaO54693 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
EdaO54693 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EdaO54693 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
EdaO54693 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EdaO54693 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EdaO54693 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EdaO54693 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EdaO54693 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EdaO54693 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EdaO54693 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EdaO54693 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EdaO54693 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EdaO54693 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EdaO54693 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EdaO54693 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EdaO54693 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EdaO54693 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EdaO54693 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EdaO54693 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EdaO54693 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EdaO54693 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EdaO54693 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EdaO54693 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EdaO54693 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EdaO54693 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EdaO54693 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EdaO54693 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EdaO54693 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EdaO54693 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EdaO54693 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
EdaO54693 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
EdaO54693 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EdaO54693 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EdaO54693 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EdaO54693 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EdaO54693 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EdaO54693 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EdaO54693 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EdaO54693 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EdaO54693 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EdaO54693 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EdaO54693 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EdaO54693 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EdaO54693 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EdaO54693 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EdaO54693 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EdaO54693 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EdaO54693 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EdaO54693 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms