Protein–RNA interactions for Protein: O35609

Scamp3, Secretory carrier-associated membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp3O35609 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scamp3O35609 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scamp3O35609 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scamp3O35609 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scamp3O35609 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scamp3O35609 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scamp3O35609 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Scamp3O35609 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scamp3O35609 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Scamp3O35609 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scamp3O35609 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scamp3O35609 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scamp3O35609 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scamp3O35609 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scamp3O35609 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scamp3O35609 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scamp3O35609 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scamp3O35609 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scamp3O35609 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scamp3O35609 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scamp3O35609 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scamp3O35609 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scamp3O35609 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scamp3O35609 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scamp3O35609 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scamp3O35609 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Scamp3O35609 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scamp3O35609 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Scamp3O35609 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scamp3O35609 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scamp3O35609 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Scamp3O35609 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scamp3O35609 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scamp3O35609 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scamp3O35609 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Scamp3O35609 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scamp3O35609 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scamp3O35609 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scamp3O35609 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scamp3O35609 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scamp3O35609 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scamp3O35609 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scamp3O35609 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scamp3O35609 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scamp3O35609 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scamp3O35609 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scamp3O35609 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scamp3O35609 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scamp3O35609 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scamp3O35609 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scamp3O35609 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scamp3O35609 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scamp3O35609 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scamp3O35609 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scamp3O35609 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scamp3O35609 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scamp3O35609 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scamp3O35609 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scamp3O35609 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scamp3O35609 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scamp3O35609 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scamp3O35609 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scamp3O35609 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scamp3O35609 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scamp3O35609 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scamp3O35609 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scamp3O35609 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scamp3O35609 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scamp3O35609 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scamp3O35609 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scamp3O35609 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scamp3O35609 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scamp3O35609 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scamp3O35609 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scamp3O35609 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scamp3O35609 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scamp3O35609 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scamp3O35609 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scamp3O35609 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scamp3O35609 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scamp3O35609 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scamp3O35609 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scamp3O35609 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scamp3O35609 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scamp3O35609 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scamp3O35609 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scamp3O35609 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scamp3O35609 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scamp3O35609 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scamp3O35609 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scamp3O35609 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Scamp3O35609 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scamp3O35609 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scamp3O35609 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scamp3O35609 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scamp3O35609 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scamp3O35609 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scamp3O35609 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scamp3O35609 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scamp3O35609 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms