Protein–RNA interactions for Protein: O35343

Kpna4, Importin subunit alpha-3, mousemouse

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Length 521 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna4O35343 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kpna4O35343 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kpna4O35343 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.2 ms