Protein–RNA interactions for Protein: O35304

Slc18a3, Vesicular acetylcholine transporter, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc18a3O35304 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Slc18a3O35304 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Slc18a3O35304 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Slc18a3O35304 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Slc18a3O35304 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Slc18a3O35304 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Slc18a3O35304 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Slc18a3O35304 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Slc18a3O35304 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Slc18a3O35304 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Slc18a3O35304 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Slc18a3O35304 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Slc18a3O35304 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Slc18a3O35304 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Slc18a3O35304 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Slc18a3O35304 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Slc18a3O35304 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Slc18a3O35304 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Slc18a3O35304 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Slc18a3O35304 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Slc18a3O35304 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Slc18a3O35304 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Slc18a3O35304 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Slc18a3O35304 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Slc18a3O35304 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Slc18a3O35304 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Slc18a3O35304 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Slc18a3O35304 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Slc18a3O35304 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Slc18a3O35304 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Slc18a3O35304 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Slc18a3O35304 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Slc18a3O35304 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Slc18a3O35304 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Slc18a3O35304 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Slc18a3O35304 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Slc18a3O35304 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Slc18a3O35304 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Slc18a3O35304 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Slc18a3O35304 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Slc18a3O35304 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Slc18a3O35304 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Slc18a3O35304 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Slc18a3O35304 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Slc18a3O35304 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Slc18a3O35304 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Slc18a3O35304 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Slc18a3O35304 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Slc18a3O35304 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Slc18a3O35304 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Slc18a3O35304 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Slc18a3O35304 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Slc18a3O35304 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Slc18a3O35304 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Slc18a3O35304 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Slc18a3O35304 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Slc18a3O35304 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Slc18a3O35304 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Slc18a3O35304 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Slc18a3O35304 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Slc18a3O35304 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Slc18a3O35304 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Slc18a3O35304 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Slc18a3O35304 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Slc18a3O35304 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Slc18a3O35304 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Slc18a3O35304 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Slc18a3O35304 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Slc18a3O35304 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Slc18a3O35304 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Slc18a3O35304 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Slc18a3O35304 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Slc18a3O35304 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Slc18a3O35304 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Slc18a3O35304 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Slc18a3O35304 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Slc18a3O35304 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Slc18a3O35304 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Slc18a3O35304 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Slc18a3O35304 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Slc18a3O35304 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Slc18a3O35304 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Slc18a3O35304 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Slc18a3O35304 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Slc18a3O35304 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Slc18a3O35304 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Slc18a3O35304 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Slc18a3O35304 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Slc18a3O35304 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Slc18a3O35304 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Slc18a3O35304 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Slc18a3O35304 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Slc18a3O35304 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Slc18a3O35304 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Slc18a3O35304 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Slc18a3O35304 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Slc18a3O35304 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Slc18a3O35304 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Slc18a3O35304 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Slc18a3O35304 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms