Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bhlhe40O35185 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms