Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Casq1O09165 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Casq1O09165 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Casq1O09165 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Casq1O09165 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Casq1O09165 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Casq1O09165 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Casq1O09165 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Casq1O09165 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Casq1O09165 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Casq1O09165 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Casq1O09165 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Casq1O09165 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Casq1O09165 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Casq1O09165 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Casq1O09165 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Casq1O09165 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Casq1O09165 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Casq1O09165 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Casq1O09165 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Casq1O09165 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Casq1O09165 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Casq1O09165 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Casq1O09165 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Casq1O09165 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Casq1O09165 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Casq1O09165 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Casq1O09165 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Casq1O09165 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Casq1O09165 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Casq1O09165 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Casq1O09165 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Casq1O09165 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Casq1O09165 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Casq1O09165 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Casq1O09165 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Casq1O09165 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Casq1O09165 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Casq1O09165 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Casq1O09165 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Casq1O09165 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Casq1O09165 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Casq1O09165 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Casq1O09165 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Casq1O09165 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Casq1O09165 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Casq1O09165 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Casq1O09165 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Casq1O09165 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Casq1O09165 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Casq1O09165 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Casq1O09165 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Casq1O09165 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Casq1O09165 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Casq1O09165 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Casq1O09165 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Casq1O09165 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Casq1O09165 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Casq1O09165 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Casq1O09165 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Casq1O09165 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Casq1O09165 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Casq1O09165 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Casq1O09165 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Casq1O09165 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Casq1O09165 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Casq1O09165 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Casq1O09165 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Casq1O09165 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Casq1O09165 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Casq1O09165 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Casq1O09165 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Casq1O09165 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Casq1O09165 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Casq1O09165 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Casq1O09165 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Casq1O09165 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Casq1O09165 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Casq1O09165 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Casq1O09165 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Casq1O09165 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Casq1O09165 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Casq1O09165 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Casq1O09165 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Casq1O09165 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Casq1O09165 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Casq1O09165 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Casq1O09165 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Casq1O09165 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Casq1O09165 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Casq1O09165 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Casq1O09165 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Casq1O09165 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Casq1O09165 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Casq1O09165 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Casq1O09165 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Casq1O09165 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Casq1O09165 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Casq1O09165 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Casq1O09165 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms