Protein–RNA interactions for Protein: O08919

Numbl, Numb-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NumblO08919 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NumblO08919 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NumblO08919 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NumblO08919 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NumblO08919 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NumblO08919 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NumblO08919 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NumblO08919 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NumblO08919 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NumblO08919 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NumblO08919 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NumblO08919 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NumblO08919 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NumblO08919 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NumblO08919 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NumblO08919 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NumblO08919 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NumblO08919 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NumblO08919 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NumblO08919 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NumblO08919 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NumblO08919 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NumblO08919 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NumblO08919 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NumblO08919 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NumblO08919 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NumblO08919 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NumblO08919 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NumblO08919 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NumblO08919 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NumblO08919 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NumblO08919 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NumblO08919 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NumblO08919 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NumblO08919 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NumblO08919 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NumblO08919 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NumblO08919 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NumblO08919 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NumblO08919 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NumblO08919 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NumblO08919 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NumblO08919 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NumblO08919 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NumblO08919 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NumblO08919 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NumblO08919 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NumblO08919 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NumblO08919 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NumblO08919 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NumblO08919 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NumblO08919 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NumblO08919 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NumblO08919 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NumblO08919 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NumblO08919 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NumblO08919 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NumblO08919 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NumblO08919 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NumblO08919 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NumblO08919 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NumblO08919 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NumblO08919 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NumblO08919 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NumblO08919 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NumblO08919 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NumblO08919 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NumblO08919 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NumblO08919 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NumblO08919 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NumblO08919 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NumblO08919 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NumblO08919 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NumblO08919 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NumblO08919 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NumblO08919 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NumblO08919 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NumblO08919 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NumblO08919 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NumblO08919 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NumblO08919 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NumblO08919 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NumblO08919 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NumblO08919 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NumblO08919 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NumblO08919 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NumblO08919 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NumblO08919 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NumblO08919 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NumblO08919 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NumblO08919 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NumblO08919 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NumblO08919 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NumblO08919 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NumblO08919 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NumblO08919 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NumblO08919 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NumblO08919 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NumblO08919 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NumblO08919 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms