Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sec22bO08547 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms