Protein–RNA interactions for Protein: O08543

Efna5, Ephrin-A5, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna5O08543 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Efna5O08543 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Efna5O08543 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Efna5O08543 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Efna5O08543 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Efna5O08543 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Efna5O08543 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Efna5O08543 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Efna5O08543 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Efna5O08543 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Efna5O08543 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efna5O08543 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Efna5O08543 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Efna5O08543 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms