Protein–RNA interactions for Protein: L7N298

Gm3424, Predicted gene 3424, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3424L7N298 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms