Protein–RNA interactions for Protein: L7N200

Gm5152, Predicted gene 5152 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5152L7N200 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5152L7N200 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5152L7N200 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm5152L7N200 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5152L7N200 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5152L7N200 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5152L7N200 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5152L7N200 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5152L7N200 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5152L7N200 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5152L7N200 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5152L7N200 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5152L7N200 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5152L7N200 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5152L7N200 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5152L7N200 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5152L7N200 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5152L7N200 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5152L7N200 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm5152L7N200 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm5152L7N200 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm5152L7N200 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm5152L7N200 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm5152L7N200 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5152L7N200 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5152L7N200 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5152L7N200 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5152L7N200 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5152L7N200 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5152L7N200 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5152L7N200 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5152L7N200 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5152L7N200 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5152L7N200 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5152L7N200 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5152L7N200 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5152L7N200 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5152L7N200 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5152L7N200 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5152L7N200 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5152L7N200 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5152L7N200 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5152L7N200 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5152L7N200 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5152L7N200 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5152L7N200 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm5152L7N200 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5152L7N200 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5152L7N200 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5152L7N200 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5152L7N200 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5152L7N200 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5152L7N200 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5152L7N200 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5152L7N200 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5152L7N200 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5152L7N200 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5152L7N200 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5152L7N200 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5152L7N200 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5152L7N200 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5152L7N200 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5152L7N200 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5152L7N200 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5152L7N200 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5152L7N200 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5152L7N200 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5152L7N200 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5152L7N200 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5152L7N200 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5152L7N200 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5152L7N200 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5152L7N200 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5152L7N200 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5152L7N200 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5152L7N200 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5152L7N200 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5152L7N200 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5152L7N200 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5152L7N200 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5152L7N200 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5152L7N200 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5152L7N200 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5152L7N200 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5152L7N200 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5152L7N200 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5152L7N200 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5152L7N200 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5152L7N200 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5152L7N200 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5152L7N200 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5152L7N200 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5152L7N200 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5152L7N200 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5152L7N200 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5152L7N200 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5152L7N200 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5152L7N200 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5152L7N200 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5152L7N200 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms