Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
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