Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU0

Spin2f, Spindlin family, member 2F, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spin2fJ3QPU0 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Spin2fJ3QPU0 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spin2fJ3QPU0 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spin2fJ3QPU0 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spin2fJ3QPU0 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spin2fJ3QPU0 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spin2fJ3QPU0 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spin2fJ3QPU0 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spin2fJ3QPU0 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spin2fJ3QPU0 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spin2fJ3QPU0 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
Spin2fJ3QPU0 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Spin2fJ3QPU0 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spin2fJ3QPU0 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spin2fJ3QPU0 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spin2fJ3QPU0 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spin2fJ3QPU0 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spin2fJ3QPU0 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spin2fJ3QPU0 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spin2fJ3QPU0 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spin2fJ3QPU0 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spin2fJ3QPU0 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spin2fJ3QPU0 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spin2fJ3QPU0 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spin2fJ3QPU0 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spin2fJ3QPU0 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spin2fJ3QPU0 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spin2fJ3QPU0 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spin2fJ3QPU0 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spin2fJ3QPU0 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spin2fJ3QPU0 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spin2fJ3QPU0 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spin2fJ3QPU0 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spin2fJ3QPU0 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spin2fJ3QPU0 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spin2fJ3QPU0 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spin2fJ3QPU0 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spin2fJ3QPU0 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spin2fJ3QPU0 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spin2fJ3QPU0 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spin2fJ3QPU0 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spin2fJ3QPU0 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spin2fJ3QPU0 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spin2fJ3QPU0 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spin2fJ3QPU0 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Spin2fJ3QPU0 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spin2fJ3QPU0 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spin2fJ3QPU0 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spin2fJ3QPU0 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spin2fJ3QPU0 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Spin2fJ3QPU0 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spin2fJ3QPU0 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spin2fJ3QPU0 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Spin2fJ3QPU0 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spin2fJ3QPU0 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spin2fJ3QPU0 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Spin2fJ3QPU0 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spin2fJ3QPU0 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spin2fJ3QPU0 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spin2fJ3QPU0 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spin2fJ3QPU0 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spin2fJ3QPU0 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spin2fJ3QPU0 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spin2fJ3QPU0 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spin2fJ3QPU0 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spin2fJ3QPU0 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spin2fJ3QPU0 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spin2fJ3QPU0 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spin2fJ3QPU0 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spin2fJ3QPU0 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spin2fJ3QPU0 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spin2fJ3QPU0 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spin2fJ3QPU0 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spin2fJ3QPU0 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spin2fJ3QPU0 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spin2fJ3QPU0 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spin2fJ3QPU0 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spin2fJ3QPU0 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spin2fJ3QPU0 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spin2fJ3QPU0 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spin2fJ3QPU0 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spin2fJ3QPU0 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spin2fJ3QPU0 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spin2fJ3QPU0 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spin2fJ3QPU0 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spin2fJ3QPU0 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spin2fJ3QPU0 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spin2fJ3QPU0 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spin2fJ3QPU0 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spin2fJ3QPU0 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spin2fJ3QPU0 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spin2fJ3QPU0 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spin2fJ3QPU0 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Spin2fJ3QPU0 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spin2fJ3QPU0 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spin2fJ3QPU0 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spin2fJ3QPU0 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spin2fJ3QPU0 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spin2fJ3QPU0 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spin2fJ3QPU0 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms