Protein–RNA interactions for Protein: J3QNM1

Cldn34c2, Claudin 34C2, mousemouse

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c2J3QNM1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34c2J3QNM1 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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