Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20918J3QN17 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20918J3QN17 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20918J3QN17 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20918J3QN17 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20918J3QN17 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20918J3QN17 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20918J3QN17 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20918J3QN17 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20918J3QN17 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20918J3QN17 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20918J3QN17 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20918J3QN17 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20918J3QN17 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20918J3QN17 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20918J3QN17 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20918J3QN17 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20918J3QN17 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20918J3QN17 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20918J3QN17 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20918J3QN17 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20918J3QN17 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20918J3QN17 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20918J3QN17 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20918J3QN17 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20918J3QN17 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20918J3QN17 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20918J3QN17 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20918J3QN17 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20918J3QN17 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20918J3QN17 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20918J3QN17 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20918J3QN17 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20918J3QN17 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20918J3QN17 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20918J3QN17 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20918J3QN17 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20918J3QN17 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20918J3QN17 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20918J3QN17 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20918J3QN17 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20918J3QN17 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20918J3QN17 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20918J3QN17 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20918J3QN17 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20918J3QN17 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20918J3QN17 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20918J3QN17 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20918J3QN17 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20918J3QN17 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20918J3QN17 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20918J3QN17 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20918J3QN17 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20918J3QN17 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20918J3QN17 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20918J3QN17 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20918J3QN17 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20918J3QN17 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20918J3QN17 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20918J3QN17 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20918J3QN17 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20918J3QN17 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20918J3QN17 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20918J3QN17 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20918J3QN17 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20918J3QN17 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20918J3QN17 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20918J3QN17 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20918J3QN17 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20918J3QN17 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20918J3QN17 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20918J3QN17 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20918J3QN17 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20918J3QN17 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20918J3QN17 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20918J3QN17 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20918J3QN17 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20918J3QN17 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20918J3QN17 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20918J3QN17 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20918J3QN17 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20918J3QN17 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20918J3QN17 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20918J3QN17 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20918J3QN17 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20918J3QN17 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20918J3QN17 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20918J3QN17 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20918J3QN17 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20918J3QN17 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20918J3QN17 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20918J3QN17 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20918J3QN17 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20918J3QN17 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20918J3QN17 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20918J3QN17 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20918J3QN17 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20918J3QN17 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20918J3QN17 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20918J3QN17 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms