Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ9

Gm20873, Predicted gene, 20873, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20873J3QMQ9 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20873J3QMQ9 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20873J3QMQ9 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20873J3QMQ9 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20873J3QMQ9 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20873J3QMQ9 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20873J3QMQ9 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20873J3QMQ9 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20873J3QMQ9 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20873J3QMQ9 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20873J3QMQ9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20873J3QMQ9 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20873J3QMQ9 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20873J3QMQ9 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20873J3QMQ9 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20873J3QMQ9 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20873J3QMQ9 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20873J3QMQ9 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20873J3QMQ9 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20873J3QMQ9 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20873J3QMQ9 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20873J3QMQ9 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20873J3QMQ9 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20873J3QMQ9 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20873J3QMQ9 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20873J3QMQ9 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20873J3QMQ9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20873J3QMQ9 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20873J3QMQ9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20873J3QMQ9 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20873J3QMQ9 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20873J3QMQ9 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20873J3QMQ9 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20873J3QMQ9 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20873J3QMQ9 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20873J3QMQ9 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20873J3QMQ9 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20873J3QMQ9 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20873J3QMQ9 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20873J3QMQ9 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20873J3QMQ9 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20873J3QMQ9 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20873J3QMQ9 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20873J3QMQ9 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20873J3QMQ9 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20873J3QMQ9 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20873J3QMQ9 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20873J3QMQ9 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20873J3QMQ9 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20873J3QMQ9 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20873J3QMQ9 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20873J3QMQ9 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20873J3QMQ9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20873J3QMQ9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20873J3QMQ9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20873J3QMQ9 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20873J3QMQ9 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20873J3QMQ9 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20873J3QMQ9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20873J3QMQ9 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20873J3QMQ9 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20873J3QMQ9 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20873J3QMQ9 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20873J3QMQ9 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20873J3QMQ9 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20873J3QMQ9 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20873J3QMQ9 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20873J3QMQ9 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20873J3QMQ9 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20873J3QMQ9 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20873J3QMQ9 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20873J3QMQ9 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20873J3QMQ9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20873J3QMQ9 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20873J3QMQ9 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20873J3QMQ9 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20873J3QMQ9 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20873J3QMQ9 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20873J3QMQ9 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20873J3QMQ9 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20873J3QMQ9 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20873J3QMQ9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20873J3QMQ9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20873J3QMQ9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20873J3QMQ9 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20873J3QMQ9 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20873J3QMQ9 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20873J3QMQ9 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20873J3QMQ9 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20873J3QMQ9 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20873J3QMQ9 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20873J3QMQ9 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20873J3QMQ9 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20873J3QMQ9 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20873J3QMQ9 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20873J3QMQ9 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20873J3QMQ9 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20873J3QMQ9 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20873J3QMQ9 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20873J3QMQ9 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms