Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem200cJ3QK46 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms