Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Gm20828J3KMI7 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Gm20828J3KMI7 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Gm20828J3KMI7 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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Gm20828J3KMI7 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20828J3KMI7 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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Gm20828J3KMI7 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
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Gm20828J3KMI7 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
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Gm20828J3KMI7 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
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Gm20828J3KMI7 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Gm20828J3KMI7 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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