Protein–RNA interactions for Protein: G3UW52

Cldn34a, Claudin 34A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34aG3UW52 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn34aG3UW52 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms