Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp9yF8VPU6 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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