Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Gm28048F7BCN0 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Gm28048F7BCN0 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Gm28048F7BCN0 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Gm28048F7BCN0 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Gm28048F7BCN0 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Gm28048F7BCN0 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Gm28048F7BCN0 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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