Protein–RNA interactions for Protein: F6YNI8

Gm21319, Predicted gene, 21319, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21319F6YNI8 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21319F6YNI8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21319F6YNI8 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21319F6YNI8 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21319F6YNI8 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21319F6YNI8 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21319F6YNI8 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21319F6YNI8 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21319F6YNI8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21319F6YNI8 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21319F6YNI8 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21319F6YNI8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21319F6YNI8 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21319F6YNI8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21319F6YNI8 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21319F6YNI8 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21319F6YNI8 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21319F6YNI8 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21319F6YNI8 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21319F6YNI8 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21319F6YNI8 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21319F6YNI8 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21319F6YNI8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21319F6YNI8 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21319F6YNI8 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21319F6YNI8 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21319F6YNI8 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21319F6YNI8 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21319F6YNI8 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21319F6YNI8 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21319F6YNI8 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21319F6YNI8 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21319F6YNI8 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21319F6YNI8 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21319F6YNI8 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21319F6YNI8 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21319F6YNI8 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21319F6YNI8 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21319F6YNI8 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21319F6YNI8 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21319F6YNI8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21319F6YNI8 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21319F6YNI8 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21319F6YNI8 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21319F6YNI8 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21319F6YNI8 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21319F6YNI8 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21319F6YNI8 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21319F6YNI8 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21319F6YNI8 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21319F6YNI8 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21319F6YNI8 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21319F6YNI8 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21319F6YNI8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21319F6YNI8 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21319F6YNI8 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21319F6YNI8 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21319F6YNI8 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21319F6YNI8 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21319F6YNI8 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21319F6YNI8 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21319F6YNI8 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21319F6YNI8 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21319F6YNI8 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21319F6YNI8 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21319F6YNI8 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21319F6YNI8 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21319F6YNI8 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21319F6YNI8 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21319F6YNI8 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21319F6YNI8 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21319F6YNI8 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21319F6YNI8 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21319F6YNI8 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21319F6YNI8 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21319F6YNI8 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21319F6YNI8 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21319F6YNI8 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21319F6YNI8 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21319F6YNI8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21319F6YNI8 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21319F6YNI8 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21319F6YNI8 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21319F6YNI8 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21319F6YNI8 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21319F6YNI8 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21319F6YNI8 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21319F6YNI8 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21319F6YNI8 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21319F6YNI8 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21319F6YNI8 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21319F6YNI8 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21319F6YNI8 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21319F6YNI8 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21319F6YNI8 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21319F6YNI8 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21319F6YNI8 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21319F6YNI8 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21319F6YNI8 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21319F6YNI8 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.1 ms