Protein–RNA interactions for Protein: F6XS56

Gm8444, Predicted gene 8444, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8444F6XS56 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms