Protein–RNA interactions for Protein: F6XQQ1

Gm10378, Predicted gene 10378 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10378F6XQQ1 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm10378F6XQQ1 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm10378F6XQQ1 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm10378F6XQQ1 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm10378F6XQQ1 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm10378F6XQQ1 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm10378F6XQQ1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm10378F6XQQ1 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm10378F6XQQ1 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm10378F6XQQ1 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm10378F6XQQ1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm10378F6XQQ1 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm10378F6XQQ1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm10378F6XQQ1 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm10378F6XQQ1 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm10378F6XQQ1 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm10378F6XQQ1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm10378F6XQQ1 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm10378F6XQQ1 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm10378F6XQQ1 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm10378F6XQQ1 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm10378F6XQQ1 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm10378F6XQQ1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm10378F6XQQ1 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm10378F6XQQ1 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm10378F6XQQ1 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm10378F6XQQ1 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm10378F6XQQ1 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm10378F6XQQ1 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm10378F6XQQ1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm10378F6XQQ1 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm10378F6XQQ1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm10378F6XQQ1 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm10378F6XQQ1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm10378F6XQQ1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm10378F6XQQ1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm10378F6XQQ1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm10378F6XQQ1 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm10378F6XQQ1 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm10378F6XQQ1 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm10378F6XQQ1 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm10378F6XQQ1 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm10378F6XQQ1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm10378F6XQQ1 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm10378F6XQQ1 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm10378F6XQQ1 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm10378F6XQQ1 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm10378F6XQQ1 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm10378F6XQQ1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm10378F6XQQ1 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm10378F6XQQ1 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm10378F6XQQ1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm10378F6XQQ1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm10378F6XQQ1 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm10378F6XQQ1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm10378F6XQQ1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm10378F6XQQ1 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm10378F6XQQ1 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm10378F6XQQ1 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm10378F6XQQ1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm10378F6XQQ1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm10378F6XQQ1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm10378F6XQQ1 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm10378F6XQQ1 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm10378F6XQQ1 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm10378F6XQQ1 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm10378F6XQQ1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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Gm10378F6XQQ1 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm10378F6XQQ1 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm10378F6XQQ1 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm10378F6XQQ1 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm10378F6XQQ1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm10378F6XQQ1 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm10378F6XQQ1 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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Gm10378F6XQQ1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm10378F6XQQ1 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm10378F6XQQ1 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm10378F6XQQ1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm10378F6XQQ1 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm10378F6XQQ1 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm10378F6XQQ1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm10378F6XQQ1 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm10378F6XQQ1 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm10378F6XQQ1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm10378F6XQQ1 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm10378F6XQQ1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm10378F6XQQ1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm10378F6XQQ1 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm10378F6XQQ1 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm10378F6XQQ1 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm10378F6XQQ1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm10378F6XQQ1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm10378F6XQQ1 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm10378F6XQQ1 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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