Protein–RNA interactions for Protein: F6XGJ4

Gm17093, Predicted gene 17093 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17093F6XGJ4 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17093F6XGJ4 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17093F6XGJ4 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17093F6XGJ4 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17093F6XGJ4 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17093F6XGJ4 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17093F6XGJ4 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17093F6XGJ4 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17093F6XGJ4 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17093F6XGJ4 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17093F6XGJ4 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17093F6XGJ4 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17093F6XGJ4 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17093F6XGJ4 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17093F6XGJ4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17093F6XGJ4 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17093F6XGJ4 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17093F6XGJ4 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17093F6XGJ4 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17093F6XGJ4 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17093F6XGJ4 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17093F6XGJ4 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17093F6XGJ4 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17093F6XGJ4 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17093F6XGJ4 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17093F6XGJ4 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17093F6XGJ4 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17093F6XGJ4 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17093F6XGJ4 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17093F6XGJ4 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17093F6XGJ4 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17093F6XGJ4 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17093F6XGJ4 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17093F6XGJ4 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17093F6XGJ4 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17093F6XGJ4 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17093F6XGJ4 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17093F6XGJ4 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17093F6XGJ4 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17093F6XGJ4 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17093F6XGJ4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17093F6XGJ4 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17093F6XGJ4 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17093F6XGJ4 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17093F6XGJ4 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17093F6XGJ4 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17093F6XGJ4 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17093F6XGJ4 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17093F6XGJ4 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17093F6XGJ4 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17093F6XGJ4 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17093F6XGJ4 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17093F6XGJ4 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17093F6XGJ4 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17093F6XGJ4 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17093F6XGJ4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17093F6XGJ4 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17093F6XGJ4 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17093F6XGJ4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17093F6XGJ4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17093F6XGJ4 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17093F6XGJ4 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17093F6XGJ4 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17093F6XGJ4 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17093F6XGJ4 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17093F6XGJ4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17093F6XGJ4 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17093F6XGJ4 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17093F6XGJ4 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17093F6XGJ4 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17093F6XGJ4 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17093F6XGJ4 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17093F6XGJ4 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17093F6XGJ4 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17093F6XGJ4 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17093F6XGJ4 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17093F6XGJ4 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17093F6XGJ4 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17093F6XGJ4 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17093F6XGJ4 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17093F6XGJ4 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17093F6XGJ4 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17093F6XGJ4 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17093F6XGJ4 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17093F6XGJ4 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17093F6XGJ4 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17093F6XGJ4 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17093F6XGJ4 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17093F6XGJ4 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17093F6XGJ4 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17093F6XGJ4 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17093F6XGJ4 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17093F6XGJ4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17093F6XGJ4 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17093F6XGJ4 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17093F6XGJ4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17093F6XGJ4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17093F6XGJ4 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17093F6XGJ4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17093F6XGJ4 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms