Protein–RNA interactions for Protein: F6URP1

Gm6619, Predicted gene 6619, mousemouse

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Length 175 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6619F6URP1 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm6619F6URP1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm6619F6URP1 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm6619F6URP1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm6619F6URP1 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm6619F6URP1 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm6619F6URP1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm6619F6URP1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm6619F6URP1 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm6619F6URP1 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm6619F6URP1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm6619F6URP1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm6619F6URP1 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm6619F6URP1 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm6619F6URP1 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm6619F6URP1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm6619F6URP1 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm6619F6URP1 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm6619F6URP1 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm6619F6URP1 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm6619F6URP1 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm6619F6URP1 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm6619F6URP1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm6619F6URP1 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm6619F6URP1 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm6619F6URP1 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm6619F6URP1 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm6619F6URP1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm6619F6URP1 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm6619F6URP1 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm6619F6URP1 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm6619F6URP1 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm6619F6URP1 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm6619F6URP1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm6619F6URP1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm6619F6URP1 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm6619F6URP1 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm6619F6URP1 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm6619F6URP1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm6619F6URP1 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm6619F6URP1 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm6619F6URP1 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm6619F6URP1 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm6619F6URP1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm6619F6URP1 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm6619F6URP1 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm6619F6URP1 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm6619F6URP1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm6619F6URP1 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm6619F6URP1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm6619F6URP1 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm6619F6URP1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm6619F6URP1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm6619F6URP1 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm6619F6URP1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6619F6URP1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6619F6URP1 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6619F6URP1 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6619F6URP1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6619F6URP1 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6619F6URP1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6619F6URP1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6619F6URP1 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6619F6URP1 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6619F6URP1 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6619F6URP1 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6619F6URP1 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6619F6URP1 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6619F6URP1 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6619F6URP1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6619F6URP1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6619F6URP1 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6619F6URP1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6619F6URP1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6619F6URP1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6619F6URP1 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6619F6URP1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6619F6URP1 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6619F6URP1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6619F6URP1 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6619F6URP1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6619F6URP1 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6619F6URP1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6619F6URP1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6619F6URP1 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6619F6URP1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6619F6URP1 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6619F6URP1 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6619F6URP1 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6619F6URP1 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6619F6URP1 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6619F6URP1 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6619F6URP1 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6619F6URP1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6619F6URP1 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6619F6URP1 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6619F6URP1 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6619F6URP1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6619F6URP1 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6619F6URP1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms