Protein–RNA interactions for Protein: F6U8B9

Gm17555, Predicted gene, 17555, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17555F6U8B9 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm17555F6U8B9 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms