Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3Y9

2610001J05Rik, RIKEN cDNA 2610001J05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610001J05RikF2Z3Y9 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.04■□□□□ -0
2610001J05RikF2Z3Y9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
2610001J05RikF2Z3Y9 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
2610001J05RikF2Z3Y9 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
2610001J05RikF2Z3Y9 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
2610001J05RikF2Z3Y9 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
2610001J05RikF2Z3Y9 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
2610001J05RikF2Z3Y9 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
2610001J05RikF2Z3Y9 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
2610001J05RikF2Z3Y9 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
2610001J05RikF2Z3Y9 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
2610001J05RikF2Z3Y9 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
2610001J05RikF2Z3Y9 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.04■□□□□ -0
2610001J05RikF2Z3Y9 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
2610001J05RikF2Z3Y9 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
2610001J05RikF2Z3Y9 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
2610001J05RikF2Z3Y9 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
2610001J05RikF2Z3Y9 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
2610001J05RikF2Z3Y9 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
2610001J05RikF2Z3Y9 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
2610001J05RikF2Z3Y9 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
2610001J05RikF2Z3Y9 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
2610001J05RikF2Z3Y9 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
2610001J05RikF2Z3Y9 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
2610001J05RikF2Z3Y9 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
2610001J05RikF2Z3Y9 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
2610001J05RikF2Z3Y9 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
2610001J05RikF2Z3Y9 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
2610001J05RikF2Z3Y9 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
2610001J05RikF2Z3Y9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
2610001J05RikF2Z3Y9 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
2610001J05RikF2Z3Y9 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
2610001J05RikF2Z3Y9 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
2610001J05RikF2Z3Y9 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
2610001J05RikF2Z3Y9 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
2610001J05RikF2Z3Y9 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
2610001J05RikF2Z3Y9 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
2610001J05RikF2Z3Y9 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
2610001J05RikF2Z3Y9 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
2610001J05RikF2Z3Y9 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
2610001J05RikF2Z3Y9 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
2610001J05RikF2Z3Y9 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
2610001J05RikF2Z3Y9 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
2610001J05RikF2Z3Y9 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.02■□□□□ -0
2610001J05RikF2Z3Y9 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
2610001J05RikF2Z3Y9 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
2610001J05RikF2Z3Y9 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
2610001J05RikF2Z3Y9 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
2610001J05RikF2Z3Y9 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
2610001J05RikF2Z3Y9 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
2610001J05RikF2Z3Y9 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
2610001J05RikF2Z3Y9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
2610001J05RikF2Z3Y9 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.02■□□□□ -0
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.02■□□□□ -0
2610001J05RikF2Z3Y9 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
2610001J05RikF2Z3Y9 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms