Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3U3

Raph1, Ras association (RalGDS/AF-6) and pleckstrin homology domains 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Raph1F2Z3U3 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Raph1F2Z3U3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Raph1F2Z3U3 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms