Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmod3E9QA62 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmod3E9QA62 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmod3E9QA62 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmod3E9QA62 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmod3E9QA62 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmod3E9QA62 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmod3E9QA62 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmod3E9QA62 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmod3E9QA62 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmod3E9QA62 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmod3E9QA62 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmod3E9QA62 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmod3E9QA62 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmod3E9QA62 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmod3E9QA62 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmod3E9QA62 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lmod3E9QA62 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lmod3E9QA62 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lmod3E9QA62 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lmod3E9QA62 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lmod3E9QA62 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lmod3E9QA62 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lmod3E9QA62 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lmod3E9QA62 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lmod3E9QA62 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lmod3E9QA62 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lmod3E9QA62 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lmod3E9QA62 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Lmod3E9QA62 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Lmod3E9QA62 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lmod3E9QA62 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lmod3E9QA62 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lmod3E9QA62 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lmod3E9QA62 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lmod3E9QA62 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lmod3E9QA62 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lmod3E9QA62 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lmod3E9QA62 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lmod3E9QA62 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lmod3E9QA62 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lmod3E9QA62 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lmod3E9QA62 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lmod3E9QA62 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Lmod3E9QA62 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lmod3E9QA62 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lmod3E9QA62 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lmod3E9QA62 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lmod3E9QA62 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lmod3E9QA62 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lmod3E9QA62 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lmod3E9QA62 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lmod3E9QA62 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lmod3E9QA62 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lmod3E9QA62 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lmod3E9QA62 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lmod3E9QA62 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lmod3E9QA62 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lmod3E9QA62 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lmod3E9QA62 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lmod3E9QA62 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Lmod3E9QA62 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Lmod3E9QA62 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Lmod3E9QA62 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lmod3E9QA62 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lmod3E9QA62 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lmod3E9QA62 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lmod3E9QA62 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lmod3E9QA62 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lmod3E9QA62 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lmod3E9QA62 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lmod3E9QA62 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lmod3E9QA62 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Lmod3E9QA62 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Lmod3E9QA62 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms