Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms