Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9P8

Rdh16f1, RDH16 family member 1, mousemouse

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f1E9Q9P8 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Rdh16f1E9Q9P8 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Rdh16f1E9Q9P8 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Rdh16f1E9Q9P8 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Rdh16f1E9Q9P8 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Rdh16f1E9Q9P8 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Rdh16f1E9Q9P8 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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