Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3L2

Pi4ka, Phosphatidylinositol 4-kinase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 2,105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pi4kaE9Q3L2 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pi4kaE9Q3L2 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pi4kaE9Q3L2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pi4kaE9Q3L2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pi4kaE9Q3L2 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pi4kaE9Q3L2 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pi4kaE9Q3L2 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pi4kaE9Q3L2 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pi4kaE9Q3L2 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pi4kaE9Q3L2 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pi4kaE9Q3L2 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pi4kaE9Q3L2 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pi4kaE9Q3L2 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pi4kaE9Q3L2 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pi4kaE9Q3L2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pi4kaE9Q3L2 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pi4kaE9Q3L2 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pi4kaE9Q3L2 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pi4kaE9Q3L2 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pi4kaE9Q3L2 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pi4kaE9Q3L2 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pi4kaE9Q3L2 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pi4kaE9Q3L2 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pi4kaE9Q3L2 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pi4kaE9Q3L2 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pi4kaE9Q3L2 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pi4kaE9Q3L2 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pi4kaE9Q3L2 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pi4kaE9Q3L2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pi4kaE9Q3L2 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pi4kaE9Q3L2 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pi4kaE9Q3L2 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pi4kaE9Q3L2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pi4kaE9Q3L2 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pi4kaE9Q3L2 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pi4kaE9Q3L2 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pi4kaE9Q3L2 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pi4kaE9Q3L2 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pi4kaE9Q3L2 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pi4kaE9Q3L2 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pi4kaE9Q3L2 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pi4kaE9Q3L2 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pi4kaE9Q3L2 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pi4kaE9Q3L2 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pi4kaE9Q3L2 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pi4kaE9Q3L2 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pi4kaE9Q3L2 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pi4kaE9Q3L2 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pi4kaE9Q3L2 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pi4kaE9Q3L2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pi4kaE9Q3L2 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pi4kaE9Q3L2 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pi4kaE9Q3L2 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pi4kaE9Q3L2 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pi4kaE9Q3L2 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pi4kaE9Q3L2 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pi4kaE9Q3L2 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pi4kaE9Q3L2 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pi4kaE9Q3L2 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pi4kaE9Q3L2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pi4kaE9Q3L2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pi4kaE9Q3L2 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pi4kaE9Q3L2 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pi4kaE9Q3L2 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pi4kaE9Q3L2 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pi4kaE9Q3L2 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pi4kaE9Q3L2 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pi4kaE9Q3L2 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pi4kaE9Q3L2 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pi4kaE9Q3L2 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pi4kaE9Q3L2 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pi4kaE9Q3L2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pi4kaE9Q3L2 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pi4kaE9Q3L2 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pi4kaE9Q3L2 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pi4kaE9Q3L2 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pi4kaE9Q3L2 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pi4kaE9Q3L2 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pi4kaE9Q3L2 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pi4kaE9Q3L2 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pi4kaE9Q3L2 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pi4kaE9Q3L2 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pi4kaE9Q3L2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pi4kaE9Q3L2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pi4kaE9Q3L2 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pi4kaE9Q3L2 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pi4kaE9Q3L2 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pi4kaE9Q3L2 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pi4kaE9Q3L2 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pi4kaE9Q3L2 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pi4kaE9Q3L2 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pi4kaE9Q3L2 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pi4kaE9Q3L2 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pi4kaE9Q3L2 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pi4kaE9Q3L2 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pi4kaE9Q3L2 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pi4kaE9Q3L2 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pi4kaE9Q3L2 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pi4kaE9Q3L2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pi4kaE9Q3L2 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms