Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0Q3

2610021A01Rik, RIKEN cDNA 2610021A01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610021A01RikE9Q0Q3 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
2610021A01RikE9Q0Q3 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
2610021A01RikE9Q0Q3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.05■□□□□ -0
2610021A01RikE9Q0Q3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
2610021A01RikE9Q0Q3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
2610021A01RikE9Q0Q3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
2610021A01RikE9Q0Q3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
2610021A01RikE9Q0Q3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
2610021A01RikE9Q0Q3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
2610021A01RikE9Q0Q3 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
2610021A01RikE9Q0Q3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
2610021A01RikE9Q0Q3 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
2610021A01RikE9Q0Q3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
2610021A01RikE9Q0Q3 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
2610021A01RikE9Q0Q3 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
2610021A01RikE9Q0Q3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
2610021A01RikE9Q0Q3 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
2610021A01RikE9Q0Q3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
2610021A01RikE9Q0Q3 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
2610021A01RikE9Q0Q3 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
2610021A01RikE9Q0Q3 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
2610021A01RikE9Q0Q3 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
2610021A01RikE9Q0Q3 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
2610021A01RikE9Q0Q3 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
2610021A01RikE9Q0Q3 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
2610021A01RikE9Q0Q3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
2610021A01RikE9Q0Q3 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
2610021A01RikE9Q0Q3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
2610021A01RikE9Q0Q3 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
2610021A01RikE9Q0Q3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
2610021A01RikE9Q0Q3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
2610021A01RikE9Q0Q3 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
2610021A01RikE9Q0Q3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
2610021A01RikE9Q0Q3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.04■□□□□ -0
2610021A01RikE9Q0Q3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
2610021A01RikE9Q0Q3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
2610021A01RikE9Q0Q3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
2610021A01RikE9Q0Q3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
2610021A01RikE9Q0Q3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
2610021A01RikE9Q0Q3 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
2610021A01RikE9Q0Q3 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
2610021A01RikE9Q0Q3 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
2610021A01RikE9Q0Q3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
2610021A01RikE9Q0Q3 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
2610021A01RikE9Q0Q3 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
2610021A01RikE9Q0Q3 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
2610021A01RikE9Q0Q3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
2610021A01RikE9Q0Q3 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
2610021A01RikE9Q0Q3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
2610021A01RikE9Q0Q3 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
2610021A01RikE9Q0Q3 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
2610021A01RikE9Q0Q3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
2610021A01RikE9Q0Q3 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
2610021A01RikE9Q0Q3 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
2610021A01RikE9Q0Q3 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
2610021A01RikE9Q0Q3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
2610021A01RikE9Q0Q3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
2610021A01RikE9Q0Q3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
2610021A01RikE9Q0Q3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
2610021A01RikE9Q0Q3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
2610021A01RikE9Q0Q3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
2610021A01RikE9Q0Q3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.03■□□□□ -0
2610021A01RikE9Q0Q3 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.03■□□□□ -0
2610021A01RikE9Q0Q3 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
2610021A01RikE9Q0Q3 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
2610021A01RikE9Q0Q3 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
2610021A01RikE9Q0Q3 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
2610021A01RikE9Q0Q3 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
2610021A01RikE9Q0Q3 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
2610021A01RikE9Q0Q3 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
2610021A01RikE9Q0Q3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
2610021A01RikE9Q0Q3 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
2610021A01RikE9Q0Q3 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
2610021A01RikE9Q0Q3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
2610021A01RikE9Q0Q3 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
2610021A01RikE9Q0Q3 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
2610021A01RikE9Q0Q3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
2610021A01RikE9Q0Q3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
2610021A01RikE9Q0Q3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
2610021A01RikE9Q0Q3 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
2610021A01RikE9Q0Q3 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
2610021A01RikE9Q0Q3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
2610021A01RikE9Q0Q3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
2610021A01RikE9Q0Q3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
2610021A01RikE9Q0Q3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
2610021A01RikE9Q0Q3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms