Protein–RNA interactions for Protein: E9PXB6

Sfta2, Surfactant-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfta2E9PXB6 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sfta2E9PXB6 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sfta2E9PXB6 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sfta2E9PXB6 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sfta2E9PXB6 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sfta2E9PXB6 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sfta2E9PXB6 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sfta2E9PXB6 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sfta2E9PXB6 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sfta2E9PXB6 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sfta2E9PXB6 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sfta2E9PXB6 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sfta2E9PXB6 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sfta2E9PXB6 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sfta2E9PXB6 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sfta2E9PXB6 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Sfta2E9PXB6 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sfta2E9PXB6 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sfta2E9PXB6 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sfta2E9PXB6 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sfta2E9PXB6 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sfta2E9PXB6 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sfta2E9PXB6 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sfta2E9PXB6 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sfta2E9PXB6 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sfta2E9PXB6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sfta2E9PXB6 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sfta2E9PXB6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sfta2E9PXB6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sfta2E9PXB6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Sfta2E9PXB6 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sfta2E9PXB6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sfta2E9PXB6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sfta2E9PXB6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sfta2E9PXB6 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sfta2E9PXB6 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sfta2E9PXB6 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sfta2E9PXB6 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sfta2E9PXB6 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sfta2E9PXB6 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sfta2E9PXB6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sfta2E9PXB6 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sfta2E9PXB6 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sfta2E9PXB6 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sfta2E9PXB6 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sfta2E9PXB6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sfta2E9PXB6 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sfta2E9PXB6 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sfta2E9PXB6 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sfta2E9PXB6 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sfta2E9PXB6 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sfta2E9PXB6 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sfta2E9PXB6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sfta2E9PXB6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sfta2E9PXB6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sfta2E9PXB6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Sfta2E9PXB6 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sfta2E9PXB6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sfta2E9PXB6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sfta2E9PXB6 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sfta2E9PXB6 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sfta2E9PXB6 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sfta2E9PXB6 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sfta2E9PXB6 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sfta2E9PXB6 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sfta2E9PXB6 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sfta2E9PXB6 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sfta2E9PXB6 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sfta2E9PXB6 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sfta2E9PXB6 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sfta2E9PXB6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sfta2E9PXB6 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sfta2E9PXB6 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sfta2E9PXB6 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sfta2E9PXB6 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sfta2E9PXB6 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sfta2E9PXB6 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sfta2E9PXB6 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sfta2E9PXB6 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sfta2E9PXB6 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sfta2E9PXB6 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sfta2E9PXB6 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sfta2E9PXB6 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sfta2E9PXB6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sfta2E9PXB6 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sfta2E9PXB6 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sfta2E9PXB6 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sfta2E9PXB6 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sfta2E9PXB6 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sfta2E9PXB6 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sfta2E9PXB6 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sfta2E9PXB6 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sfta2E9PXB6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Sfta2E9PXB6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sfta2E9PXB6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sfta2E9PXB6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sfta2E9PXB6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sfta2E9PXB6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sfta2E9PXB6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sfta2E9PXB6 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms