Protein–RNA interactions for Protein: D4PHA7

Wscd2, WSC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wscd2D4PHA7 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Wscd2D4PHA7 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Wscd2D4PHA7 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Wscd2D4PHA7 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Wscd2D4PHA7 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Wscd2D4PHA7 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Wscd2D4PHA7 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Wscd2D4PHA7 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Wscd2D4PHA7 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Wscd2D4PHA7 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Wscd2D4PHA7 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Wscd2D4PHA7 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Wscd2D4PHA7 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Wscd2D4PHA7 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Wscd2D4PHA7 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Wscd2D4PHA7 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Wscd2D4PHA7 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Wscd2D4PHA7 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Wscd2D4PHA7 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Wscd2D4PHA7 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Wscd2D4PHA7 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Wscd2D4PHA7 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Wscd2D4PHA7 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Wscd2D4PHA7 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Wscd2D4PHA7 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Wscd2D4PHA7 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Wscd2D4PHA7 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Wscd2D4PHA7 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Wscd2D4PHA7 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Wscd2D4PHA7 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Wscd2D4PHA7 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Wscd2D4PHA7 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Wscd2D4PHA7 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Wscd2D4PHA7 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Wscd2D4PHA7 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Wscd2D4PHA7 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Wscd2D4PHA7 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Wscd2D4PHA7 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Wscd2D4PHA7 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Wscd2D4PHA7 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Wscd2D4PHA7 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Wscd2D4PHA7 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Wscd2D4PHA7 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Wscd2D4PHA7 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Wscd2D4PHA7 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Wscd2D4PHA7 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Wscd2D4PHA7 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Wscd2D4PHA7 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Wscd2D4PHA7 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Wscd2D4PHA7 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Wscd2D4PHA7 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Wscd2D4PHA7 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Wscd2D4PHA7 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Wscd2D4PHA7 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Wscd2D4PHA7 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Wscd2D4PHA7 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wscd2D4PHA7 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wscd2D4PHA7 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wscd2D4PHA7 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wscd2D4PHA7 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wscd2D4PHA7 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wscd2D4PHA7 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wscd2D4PHA7 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wscd2D4PHA7 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wscd2D4PHA7 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wscd2D4PHA7 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wscd2D4PHA7 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wscd2D4PHA7 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wscd2D4PHA7 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wscd2D4PHA7 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wscd2D4PHA7 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wscd2D4PHA7 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Wscd2D4PHA7 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wscd2D4PHA7 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Wscd2D4PHA7 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wscd2D4PHA7 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wscd2D4PHA7 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wscd2D4PHA7 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wscd2D4PHA7 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wscd2D4PHA7 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wscd2D4PHA7 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wscd2D4PHA7 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wscd2D4PHA7 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wscd2D4PHA7 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wscd2D4PHA7 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wscd2D4PHA7 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wscd2D4PHA7 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wscd2D4PHA7 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wscd2D4PHA7 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wscd2D4PHA7 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wscd2D4PHA7 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wscd2D4PHA7 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wscd2D4PHA7 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wscd2D4PHA7 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Wscd2D4PHA7 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wscd2D4PHA7 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wscd2D4PHA7 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wscd2D4PHA7 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wscd2D4PHA7 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wscd2D4PHA7 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms