Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6W3

Rdh8, Retinol dehydrogenase 8, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh8D3Z6W3 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rdh8D3Z6W3 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rdh8D3Z6W3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rdh8D3Z6W3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rdh8D3Z6W3 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rdh8D3Z6W3 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rdh8D3Z6W3 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rdh8D3Z6W3 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rdh8D3Z6W3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rdh8D3Z6W3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rdh8D3Z6W3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rdh8D3Z6W3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rdh8D3Z6W3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rdh8D3Z6W3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rdh8D3Z6W3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rdh8D3Z6W3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rdh8D3Z6W3 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rdh8D3Z6W3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rdh8D3Z6W3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rdh8D3Z6W3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rdh8D3Z6W3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rdh8D3Z6W3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rdh8D3Z6W3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rdh8D3Z6W3 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rdh8D3Z6W3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rdh8D3Z6W3 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rdh8D3Z6W3 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rdh8D3Z6W3 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rdh8D3Z6W3 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rdh8D3Z6W3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rdh8D3Z6W3 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rdh8D3Z6W3 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rdh8D3Z6W3 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rdh8D3Z6W3 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rdh8D3Z6W3 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rdh8D3Z6W3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rdh8D3Z6W3 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rdh8D3Z6W3 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rdh8D3Z6W3 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rdh8D3Z6W3 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rdh8D3Z6W3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rdh8D3Z6W3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rdh8D3Z6W3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rdh8D3Z6W3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rdh8D3Z6W3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rdh8D3Z6W3 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rdh8D3Z6W3 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rdh8D3Z6W3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rdh8D3Z6W3 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rdh8D3Z6W3 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rdh8D3Z6W3 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rdh8D3Z6W3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rdh8D3Z6W3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rdh8D3Z6W3 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rdh8D3Z6W3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rdh8D3Z6W3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rdh8D3Z6W3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rdh8D3Z6W3 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rdh8D3Z6W3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rdh8D3Z6W3 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rdh8D3Z6W3 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rdh8D3Z6W3 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rdh8D3Z6W3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rdh8D3Z6W3 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rdh8D3Z6W3 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rdh8D3Z6W3 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rdh8D3Z6W3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rdh8D3Z6W3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rdh8D3Z6W3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rdh8D3Z6W3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rdh8D3Z6W3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rdh8D3Z6W3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rdh8D3Z6W3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rdh8D3Z6W3 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rdh8D3Z6W3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rdh8D3Z6W3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rdh8D3Z6W3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rdh8D3Z6W3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rdh8D3Z6W3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rdh8D3Z6W3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rdh8D3Z6W3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rdh8D3Z6W3 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rdh8D3Z6W3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rdh8D3Z6W3 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rdh8D3Z6W3 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rdh8D3Z6W3 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rdh8D3Z6W3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rdh8D3Z6W3 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rdh8D3Z6W3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rdh8D3Z6W3 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rdh8D3Z6W3 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rdh8D3Z6W3 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rdh8D3Z6W3 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rdh8D3Z6W3 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rdh8D3Z6W3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rdh8D3Z6W3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rdh8D3Z6W3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rdh8D3Z6W3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Rdh8D3Z6W3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms