Protein–RNA interactions for Protein: D3YXS5

Kif28p, Kinesin-like protein KIF28P, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif28pD3YXS5 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms