Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

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Length 519 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Samd1D3YXK1 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Samd1D3YXK1 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Samd1D3YXK1 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Samd1D3YXK1 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Samd1D3YXK1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Samd1D3YXK1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Samd1D3YXK1 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Samd1D3YXK1 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Samd1D3YXK1 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Samd1D3YXK1 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Samd1D3YXK1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Samd1D3YXK1 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Samd1D3YXK1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Samd1D3YXK1 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Samd1D3YXK1 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Samd1D3YXK1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Samd1D3YXK1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Samd1D3YXK1 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Samd1D3YXK1 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Samd1D3YXK1 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Samd1D3YXK1 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Samd1D3YXK1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Samd1D3YXK1 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Samd1D3YXK1 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Samd1D3YXK1 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Samd1D3YXK1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Samd1D3YXK1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Samd1D3YXK1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Samd1D3YXK1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Samd1D3YXK1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Samd1D3YXK1 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Samd1D3YXK1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Samd1D3YXK1 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Samd1D3YXK1 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Samd1D3YXK1 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Samd1D3YXK1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
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