Protein–RNA interactions for Protein: D3YUH6

Ube2d4, Ubiquitin-conjugating enzyme E2D 4, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d4D3YUH6 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ube2d4D3YUH6 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ube2d4D3YUH6 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ube2d4D3YUH6 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ube2d4D3YUH6 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ube2d4D3YUH6 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ube2d4D3YUH6 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ube2d4D3YUH6 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ube2d4D3YUH6 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ube2d4D3YUH6 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ube2d4D3YUH6 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ube2d4D3YUH6 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ube2d4D3YUH6 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ube2d4D3YUH6 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ube2d4D3YUH6 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ube2d4D3YUH6 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ube2d4D3YUH6 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ube2d4D3YUH6 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ube2d4D3YUH6 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ube2d4D3YUH6 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ube2d4D3YUH6 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ube2d4D3YUH6 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ube2d4D3YUH6 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ube2d4D3YUH6 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ube2d4D3YUH6 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ube2d4D3YUH6 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ube2d4D3YUH6 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ube2d4D3YUH6 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ube2d4D3YUH6 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ube2d4D3YUH6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ube2d4D3YUH6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ube2d4D3YUH6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ube2d4D3YUH6 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ube2d4D3YUH6 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ube2d4D3YUH6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ube2d4D3YUH6 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ube2d4D3YUH6 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ube2d4D3YUH6 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ube2d4D3YUH6 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ube2d4D3YUH6 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ube2d4D3YUH6 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ube2d4D3YUH6 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ube2d4D3YUH6 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ube2d4D3YUH6 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ube2d4D3YUH6 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ube2d4D3YUH6 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ube2d4D3YUH6 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ube2d4D3YUH6 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ube2d4D3YUH6 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ube2d4D3YUH6 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ube2d4D3YUH6 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ube2d4D3YUH6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ube2d4D3YUH6 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ube2d4D3YUH6 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ube2d4D3YUH6 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ube2d4D3YUH6 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ube2d4D3YUH6 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ube2d4D3YUH6 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ube2d4D3YUH6 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ube2d4D3YUH6 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ube2d4D3YUH6 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms