Protein–RNA interactions for Protein: C8YR32

Loxhd1, Lipoxygenase homology domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Loxhd1C8YR32 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Loxhd1C8YR32 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Loxhd1C8YR32 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Loxhd1C8YR32 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Loxhd1C8YR32 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Loxhd1C8YR32 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Loxhd1C8YR32 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Loxhd1C8YR32 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Loxhd1C8YR32 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Loxhd1C8YR32 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Loxhd1C8YR32 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Loxhd1C8YR32 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Loxhd1C8YR32 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Loxhd1C8YR32 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Loxhd1C8YR32 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Loxhd1C8YR32 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Loxhd1C8YR32 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Loxhd1C8YR32 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Loxhd1C8YR32 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Loxhd1C8YR32 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Loxhd1C8YR32 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Loxhd1C8YR32 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Loxhd1C8YR32 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Loxhd1C8YR32 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Loxhd1C8YR32 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Loxhd1C8YR32 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Loxhd1C8YR32 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Loxhd1C8YR32 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Loxhd1C8YR32 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Loxhd1C8YR32 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Loxhd1C8YR32 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Loxhd1C8YR32 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Loxhd1C8YR32 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Loxhd1C8YR32 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Loxhd1C8YR32 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Loxhd1C8YR32 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Loxhd1C8YR32 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Loxhd1C8YR32 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Loxhd1C8YR32 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Loxhd1C8YR32 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Loxhd1C8YR32 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Loxhd1C8YR32 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Loxhd1C8YR32 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Loxhd1C8YR32 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Loxhd1C8YR32 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Loxhd1C8YR32 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Loxhd1C8YR32 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Loxhd1C8YR32 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Loxhd1C8YR32 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Loxhd1C8YR32 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Loxhd1C8YR32 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Loxhd1C8YR32 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Loxhd1C8YR32 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Loxhd1C8YR32 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Loxhd1C8YR32 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Loxhd1C8YR32 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Loxhd1C8YR32 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Loxhd1C8YR32 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Loxhd1C8YR32 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Loxhd1C8YR32 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Loxhd1C8YR32 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Loxhd1C8YR32 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Loxhd1C8YR32 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Loxhd1C8YR32 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Loxhd1C8YR32 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Loxhd1C8YR32 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Loxhd1C8YR32 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Loxhd1C8YR32 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Loxhd1C8YR32 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Loxhd1C8YR32 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Loxhd1C8YR32 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Loxhd1C8YR32 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Loxhd1C8YR32 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Loxhd1C8YR32 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Loxhd1C8YR32 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Loxhd1C8YR32 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Loxhd1C8YR32 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Loxhd1C8YR32 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Loxhd1C8YR32 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Loxhd1C8YR32 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Loxhd1C8YR32 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Loxhd1C8YR32 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Loxhd1C8YR32 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Loxhd1C8YR32 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Loxhd1C8YR32 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Loxhd1C8YR32 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Loxhd1C8YR32 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Loxhd1C8YR32 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Loxhd1C8YR32 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Loxhd1C8YR32 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Loxhd1C8YR32 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Loxhd1C8YR32 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Loxhd1C8YR32 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Loxhd1C8YR32 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Loxhd1C8YR32 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Loxhd1C8YR32 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Loxhd1C8YR32 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Loxhd1C8YR32 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Loxhd1C8YR32 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Loxhd1C8YR32 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms