Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm17333C6EQI3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm17333C6EQI3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm17333C6EQI3 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm17333C6EQI3 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm17333C6EQI3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm17333C6EQI3 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm17333C6EQI3 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm17333C6EQI3 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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