Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ80

Pdzd8, PDZ domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd8B9EJ80 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdzd8B9EJ80 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdzd8B9EJ80 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms