Protein–RNA interactions for Protein: B2RQG2

Phf3, PHD finger protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf3B2RQG2 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms