Protein–RNA interactions for Protein: B1B0R1

Gm2012, Predicted gene 2012, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2012B1B0R1 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm2012B1B0R1 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm2012B1B0R1 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm2012B1B0R1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm2012B1B0R1 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm2012B1B0R1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm2012B1B0R1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm2012B1B0R1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm2012B1B0R1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm2012B1B0R1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm2012B1B0R1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm2012B1B0R1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm2012B1B0R1 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm2012B1B0R1 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm2012B1B0R1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm2012B1B0R1 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm2012B1B0R1 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm2012B1B0R1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm2012B1B0R1 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm2012B1B0R1 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm2012B1B0R1 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm2012B1B0R1 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm2012B1B0R1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm2012B1B0R1 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm2012B1B0R1 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm2012B1B0R1 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm2012B1B0R1 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm2012B1B0R1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm2012B1B0R1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm2012B1B0R1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm2012B1B0R1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm2012B1B0R1 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm2012B1B0R1 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm2012B1B0R1 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm2012B1B0R1 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm2012B1B0R1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm2012B1B0R1 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm2012B1B0R1 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms