Protein–RNA interactions for Protein: B1AUS7

Ssxa1, Protein SSXA1, mousemouse

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Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxa1B1AUS7 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssxa1B1AUS7 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssxa1B1AUS7 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssxa1B1AUS7 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssxa1B1AUS7 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssxa1B1AUS7 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssxa1B1AUS7 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssxa1B1AUS7 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssxa1B1AUS7 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssxa1B1AUS7 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssxa1B1AUS7 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssxa1B1AUS7 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssxa1B1AUS7 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssxa1B1AUS7 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssxa1B1AUS7 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssxa1B1AUS7 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssxa1B1AUS7 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssxa1B1AUS7 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssxa1B1AUS7 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssxa1B1AUS7 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssxa1B1AUS7 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssxa1B1AUS7 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssxa1B1AUS7 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssxa1B1AUS7 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssxa1B1AUS7 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssxa1B1AUS7 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssxa1B1AUS7 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssxa1B1AUS7 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssxa1B1AUS7 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssxa1B1AUS7 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssxa1B1AUS7 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssxa1B1AUS7 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssxa1B1AUS7 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssxa1B1AUS7 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssxa1B1AUS7 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssxa1B1AUS7 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssxa1B1AUS7 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssxa1B1AUS7 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssxa1B1AUS7 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssxa1B1AUS7 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssxa1B1AUS7 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssxa1B1AUS7 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssxa1B1AUS7 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssxa1B1AUS7 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssxa1B1AUS7 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssxa1B1AUS7 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssxa1B1AUS7 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssxa1B1AUS7 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssxa1B1AUS7 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssxa1B1AUS7 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssxa1B1AUS7 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssxa1B1AUS7 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssxa1B1AUS7 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssxa1B1AUS7 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssxa1B1AUS7 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssxa1B1AUS7 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssxa1B1AUS7 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssxa1B1AUS7 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssxa1B1AUS7 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Ssxa1B1AUS7 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssxa1B1AUS7 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Ssxa1B1AUS7 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssxa1B1AUS7 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssxa1B1AUS7 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssxa1B1AUS7 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Ssxa1B1AUS7 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssxa1B1AUS7 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssxa1B1AUS7 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssxa1B1AUS7 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssxa1B1AUS7 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssxa1B1AUS7 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssxa1B1AUS7 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssxa1B1AUS7 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssxa1B1AUS7 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssxa1B1AUS7 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssxa1B1AUS7 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssxa1B1AUS7 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssxa1B1AUS7 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssxa1B1AUS7 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssxa1B1AUS7 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssxa1B1AUS7 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssxa1B1AUS7 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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