Protein–RNA interactions for Protein: A6X8Z9

4930435E12Rik, RIKEN cDNA 4930435E12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930435E12RikA6X8Z9 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
4930435E12RikA6X8Z9 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
4930435E12RikA6X8Z9 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
4930435E12RikA6X8Z9 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
4930435E12RikA6X8Z9 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms