Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Odf2A3KGV1 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms