Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6880A3KG45 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6880A3KG45 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6880A3KG45 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6880A3KG45 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6880A3KG45 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6880A3KG45 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6880A3KG45 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm6880A3KG45 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm6880A3KG45 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm6880A3KG45 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm6880A3KG45 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
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Gm6880A3KG45 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Gm6880A3KG45 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Gm6880A3KG45 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Gm6880A3KG45 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Gm6880A3KG45 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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